第三代测序技术_高通量测序技术的应用_solexa测序技术

《三代测序技术与多组学》涵盖了三代测序技术的原理、应用、最新研究成果和发展趋势,以章节形式展现三代测序技术在基因组学、转录组学、宏组学和医疗领域的特色应用场景,同时简要介绍高通量二代测序技术在相关领域的应用。帮助研究者在自己的专业领域中,选择最适宜和更具性价比的组学技术。

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第三代测序技术_solexa测序技术_高通量测序技术的应用

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高通量测序技术的应用_solexa测序技术_第三代测序技术

三代测序有多抢手,1+1>2的绝妙多组学cp来了:

Part 1 当三代测序遇到基因组学

由于三代测序具有超长读长、数据偏差小的特点,不仅可以确保基因组测序的深度和准确度,还能够覆盖和填补基因组上较大跨度的难组装区。在细菌、真菌、病毒以及动植物基因组中,三代测序都得到了广泛的应用,其特点如下:

为细菌基因组中基因多拷贝、RNA操纵子连续性和生物合成基因簇的研究提供可靠测序方案;

完美解决动植物基因组中端粒、着丝粒等特殊基因结构的组装问题,有效改善对结构变异(SV)的分析,加深对遗传多样性和进化研究的理解;

有效定位病毒整合断点、确定插入位点偏好性及整合的疾病状态。

Part 2当三代测序遇到微生态研究

当前,在研究群落问题的过程中,使用最多的手段是扩增子技术以及宏组学测序技术,随着三代测序技术的诞生,相比二代同类型技术而言第三代测序技术,又增添了许多优势:

在扩增子研究中,大幅提升种水平物种鉴定率,三代测序无需PCR过程,能够实现对样本的最佳还原,极大推进微生态群落结构中物种鉴定的精确度和准确性;

在宏组学研究中,不但能够微生物群落鉴定的分辨率,鉴定得到更多的基因数量,对MAGs的组装效果也有极大幅度的提升,能够获得更多、更完整、质量更高的MAGs,为深入研究复杂环境中的微生物和病毒提供了更详实的资料。

Part 3 当三代测序遇到转录组

三代测序正在彻底改变转录组的分析方式,揭示转录组复杂性的更多方面:

直接获得完整的全转录本,无需进一步组装拼接,能够鉴定更多的新基因,更真实的反映测序物种的转录组信息;

能够检测多种可变剪切形式第三代测序技术,发现更多的剪接位点和可变剪切事件,获得准确的变多聚腺苷酸化位点,改善基因组注释信息;

鉴定融合基因、lncRNA、天然翻译转录本和碱基修饰情况,拓展转录组研究的深度和广度。

Part 4 当三代测序遇到细胞器基因组

直接覆盖基因组复杂和重复区域信息,组装不再依赖近缘物种已有结果;

获得更多SNP、indel和SV信息,进一步用于选择压力和系统进化分析;

探究原发性线粒体疾病,识别mtDNA甲基化

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